Історія заснування ботанічного саду в Полтаві сягає початку XX століття. Тоді при педагогічному інституті було створено агробіологічну станцію. Це був плодовий сад, де також вирощували овочі та злакові культури. Утім, агробіологічна станція слугувала навчальною базою виключно для студентів природничого факультету
До 30-х років XX століття ця територія була знайома мешканцям м. Полтави як архієрейський плодовий сад із частковими декоративними насадженнями. Через деякий час його частину, площею 5,25 га, було реорганізовано на агробіологічну станцію, тоді вже педінституту. Станція являла собою плодовий сад з овочевою і польовою сівозмінами та використовувалася як навчальна база виключно для студентів
Цілеспрямоване комплектування та збереження колекційних фондів - одне з основних завдань ботанічних садів. Це важливий шлях як для вивчення біологічних особливостей інтродуцентів, так і для розширення асортименту рослин для пропаганди фіторізноманіття та цілей фітодизайну.
Ботанічний сад Полтавського національного педагогічного університету імені В.Г. Короленка є одним із вагомих центрів інтродукційної діяльності на Полтавщині. Його площа становить 5,25 гектарів. Рельєф території дещо хвилястий. Територія ботанічного саду розподілена притокою р. Тарапуньки на дві частини - північний і південний схил